然而，TAPS目前仍依赖较多DNA输入，尚未实现单细胞层面的应用。近期Scherer等人开发了一项利用内源性表观遗传标记进行克隆追溯的EPIClone技术。通过这项技术，该团队发现DNA甲基化信息可解构为两个独立层面：一部分“动态”CpG位点的甲基化状态与细胞分化进程相关，而另一部分“静态”CpG位点则会发生随机且可稳定遗传的体细胞表观突变，后者可作为示踪克隆身份的“内源性条形码”。
 

他们进一步将该技术应用于造血衰老研究时发现，年轻人体中活跃的HSCs每天生成1000~2000亿个新血细胞，但50岁后，大量HSCs退出竞争，少数大型克隆开始主导造血功能，这一进程在60岁后显著加速，并最终导致HSCs库多样性丧失。该研究证明了无论是否存在已知的克隆性造血驱动突变，年龄相关的克隆扩增均表现出相似的谱系偏向，为在生理及病理状态下深入研究HSCs克隆动力学提供了强有力的工具。综上所述，单细胞DNA甲基化测序提供了稳定的、可遗传的表观遗传信息，揭示了表观遗传异质性在细胞命运与衰老中的重要作用，但其反映的甲基化状态相对静态，难以灵敏地响应基因表达的瞬时变化与细胞状态的快速转换。
 

出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬，董芳。