与此呼应，Benam等人同样将scRNA-seq和蛋白质组学相整合，系统研究了人肺小气道上皮细胞来源的外泌体对HSCs功能的调控作用，打破了长期HSCs的稳态调节仅发生于骨髓微环境的传统观点。他们开发了单细胞外泌体追踪技术，结合scRNA-seq、外泌体miRNA测序与蛋白质组学，发现肺源外泌体可被HSCs长期特异性摄取，并通过其携带的蛋白质和miRNA调控关键基因的表达，进而增强HSCs的自我更新能力、移植效率及抗凋亡潜能。
 

此外，该研究进一步通过多组学网络分析构建了外泌体成分与HSCs基因表达之间的调控网络，揭示了肺源外泌体在抑制炎症反应、维持HSCs静息状态及促进HSCs扩增中的新机制。这一成果不仅拓展了对跨器官信号通路的理解，也展示了单细胞多组学整合在解析细胞间通讯与HSCs命运调控中的强大能力。总体来看，单细胞多组学整合分析不仅依赖实验平台的进步，也需要针对不同组学数据的结构特点选择合适的计算策略。按照整合的阶段，现有策略通常可概括为早期整合、后期整合和中期整合。
 

出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬，董芳。