当前，技术前沿更侧重于构建复杂的类器官共培养体系，通过引入免疫细胞、间充质细胞或共生微生物群等组分，以更全面地模拟体内肠道微环境及细胞间互作。感染模型的建立需精准模拟由宿主细胞分化状态决定的病原体嗜性与互作特异性。细胞分化过程会改变表面受体、宿主因子及细胞骨架结构的表达，直接影响不同病原体的感染效率。例如，鼠伤寒沙门氏菌主要利用III型分泌系统侵袭分化成熟的吸收性肠上皮细胞；轮状病毒与诺如病毒则严格依赖富集于终末分化细胞顶膜的特定受体完成感染；而隐孢子虫等寄生虫的生命周期亦与宿主细胞的分化状态紧密关联。
 

因此，能够再现完整上皮细胞分化谱系与极性的肠道类器官，为研究这些特异性感染机制提供了独特平台。目前，已有多种基于肠道类器官的衍生模型成功用于宿主-病原体互作研究。研究者可采用显微注射技术将细菌或寄生虫直接递送至类器官腔，模拟自然感染途径。另一种方法是诱导产生“极性反转”类器官，使其顶面外翻，已被用于研究鼠伤寒沙门氏菌、单核细胞增生李斯特菌等的顶面入侵机制。将3D类器官解离后形成的二维单层上皮模型，因其接种操作简便、易于监测，已成为研究病毒如诺如病毒和细菌感染的常用体系。
 

出自《肠道类器官模型在食源性致病微生物研究中的进展与挑战》作者郑军龙，付贵，张小蓝。