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B-ALL微环境单细胞转录景观2026-07-28 08:53:44

近期Blanco团队通过对来自儿童B-急性淋巴细胞白血病患者的骨髓样本进行scRNAseq,鉴定了两种不同的间充质干细胞群体,早期间质祖细胞和脂肪生成祖细胞,并通过空间转录组分析进一步揭示了这些细胞类型的定位。转录组分析显示,B-ALL细胞与不同间质亚型的相互作用存在差异。这些研究提供了B-ALL微环境的全面单细胞转录景观,突显了B-ALL微环境的复杂性,并确定了白血病细胞可以参与的不同专门化间质微环境,挑战了B-ALL中基质细胞群体均质性的传统观点,并强调在基质微环境中考虑细胞异质性的重要性,为B-ALL微环境的细胞复杂性提供了新的见解。

然而,scRNA-seq技术存在着固有局限,它仅能揭示细胞当前的基因表达状态,而无法阐释其背后的调控原因,亦无法有效预测细胞的分化潜能与未来功能尽管scRNA-seq技术能够精细描绘细胞的转录状态,但大量研究表明,mRNA的丰度与相应蛋白质的丰度之间常呈现较低的相关性,这主要是由转录后调控,特别是翻译效率的差异所导致的。翻译组学旨在系统性研究被核糖体翻译的所有mRNA及其翻译效率,是连接转录组与蛋白质组的关键桥梁。
 
单细胞翻译组学技术的突破,使得在细胞分辨率下直接观测蛋白质合成成为可能。目前,单细胞水平的翻译组分析主要通过对核糖体保护的mRNA片段进行测序来实现。其核心原理是:当核糖体与mRNA结合进行翻译时,其物理结构会保护约20~30个核苷酸的片段免于核酸酶消化。通过分离这些RPF并进行建库测序,即可精确识别正在被活跃翻译的mRNA,并量化其翻译效率。借此可以发现,单细胞翻译组学更关注单个细胞内转录本是否处于被核糖体实际翻译的状态,因此能够进一步揭示转录水平与蛋白质合成水平之间的不一致。
 
出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬,董芳。