肠道类器官模型恰恰满足了这一需求，其能够精准再现细菌的黏附侵袭、毒力因子功能、上皮屏障损伤及宿主免疫应答等动态过程，极大推动了相关机制研究与新型防控策略的开发。志贺氏菌属是细菌性痢疾的主要病原体，其导致的疾病负担与耐药性问题日益严峻。该菌主要通过粪-口途径传播，能够穿透肠黏膜黏液层并侵袭上皮细胞。由于志贺氏菌具有严格的人类宿主特异性，传统动物模型难以真实模拟其感染过程，而肠道类器官模型则为深入研究其致病机制提供了关键平台。目前，该模型已广泛应用于揭示志贺氏菌的分子致病机制、多维感染策略以及评估新型防治策略。
 

肠道类器官突破了传统模型的分辨率限制，使其能够在分子水平上系统绘制志贺氏菌毒力因子的功能图谱。2019年，Chanin等利用结肠类器官开展转录组与遗传学分析，证实多个原被注释为假基因的黏附相关操纵子仍具功能，从而阐明了细菌实现初始定植的分子基础。2025年，Di Martino等进一步将类器官感染模型与高通量遗传筛选相结合，绘制了志贺氏菌全基因组范围的毒力基因图谱，并揭示了tRNA修饰通过调控密码子使用偏好全面影响毒力程序的新机制。基于肠道类器官的细胞多样性与区域特异性，研究者得以实时追踪志贺氏菌从黏附到胞内传播的完整时空轨迹，并揭示其在不同肠段的感染偏好。
 

出自《肠道类器官模型在食源性致病微生物研究中的进展与挑战》作者郑军龙，付贵，张小蓝。