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生物医药研发信息系统的底层标准化能力提升2023-11-24 08:40:13

一是顶层设计挑战。随着研究集成平台数量和种类的不断丰富,具有创新能力的整合集群生态成为当下生物医药研发基础设施建设的重要方向。新的交叉研究领域的出现将带来新的数据资源空间,量子计算等新技术的发展将带来新的计算能力,该趋势下科学融合迭代研发基础设施建设可认为是一个永恒的议题。理想的模式是通过科学建立顶层框架,从上至下有序引导生物医药研发基础设施在数字空间内不断集成、整合、融合发展,形成丰富规整的资源管线,规模化装载至具有国际影响力的创新数字基础设施平台并持续维护。通过提供一个集中的数字平台或是集中的web入口连接所有资源作为基础设施,支持研发人员工程化开展并完成关乎生命科学、人类健康和产业化的研究任务。新兴能力基础设施由下而上进行孵化和规模化发展,并与整体框架相协同。针对面向新时期和未来的生物医药研发数字基础设施进行顶层设计是一项充满挑战的任务。

二是研发数字基础设施管理和治理挑战。要建立一个完整且必要的支持科学研究能力的、连贯的基础设施存在诸多挑战,包括平台互操作能力、平台合力建设和可持续运营建设。在整合模式下,解决大量数据源或工具源的独立和异构问题,包括格式、语法和模式等的高度差异均是掣肘资源互通共享和平台集成的关键。美国、欧盟等国家和地区经过国际标准组织和研究院校等的长期研究,在发现、查询以及集成异构语法、结构、格式和生物医学实体符号等方面,已研制了本体、元数据、数据集等针对生物医学和健康信息数据资源的系列标准,通过共享标识符、丰富的元数据、基于本体的工具、基于可扩展标记语言格式和应用程序编程接口的灵活交换系统来解决互操作性问题。
 
近年来,基于标准化的信息和平台互操作能力提升工作在国内开始获得高度关注,但相关标准制定和标准化方面的相关工作推进仍然相对落后,针对生物医药研发信息系统的底层标准化能力有待提升。
 
出自《生物医药研发数字基础设施体系建设研究》作者张建楠,王晓杰,沙雏淋.